深圳市儿童医院是市卫生和人口计划生育委员会直接领导下的集医疗、保健、科研、教学为一体的现代化儿童综合医院。承担着深圳市1400万人口及东莞、惠州、汕头等周边十几个地区的儿童医疗保健任务，是深圳市儿科医疗、急救中心，服务对象为18岁以下的少年儿童及新生儿。

医院于1997年11月开院，位于深圳市中心区著名的莲花山公园南面，与深圳市音乐厅、图书馆、青少年宫及市政府为邻。医院占地面积4.3万平方米，建筑面积约6.3万平方米，拥有职工1000多人。日均门、急诊量4000多人次，开放病床600张，年门、急诊量近150万人次，年住院病人3万余人次，年开展手术1万例。设有5个内科病区、5个外科病区、五官病区及重症医学科(含NICU和 PICU)，专业设置齐全，涵盖了大型综合儿童医院所有的业务科室。医院拥有价值2个亿的先进诊疗设备，包括磁共振、双层螺旋CT、DSA、彩色超声诊断仪、24小时动态脑电图、128H和64H数字化视频脑电图仪、电子胃镜、腹腔镜、体外循环机、婴幼儿肺功能仪、血滤/血透器、化学发光仪、特定蛋白测试仪、流式细胞仪等，还配有先进的层流无菌手术室及早产儿无菌层流室。

医院技术力量雄厚，是中国医科大学深圳儿科临床学院，重庆医科大学附属深圳儿童医院，遵义医学院教学医院及研究生培训基地。医院现有正高职称专业人员74人，副高职称专业人员95人，博士生导师2人，硕士生导师12人，享受国务院政府特殊津贴者2人,归国高级人才7名。医务人员中，有医学博士后2人，医学博士37人，硕士研究生179人。

医院设有儿科研究所，有小儿分子生物学等7个实验室，每年承担国家、省市科研项目多项。经过十余年的艰苦奋斗和拼搏创新，目前医院已有1个省级重点医学学科(小儿呼吸专科), 7个深圳市重点医学专科(小儿血液肿瘤、小儿免疫、小儿呼吸、小儿神经病学专业、新生儿专业、小儿外科、儿童重症医学科)。2011年，医院共获得科研课题36项，其中国家自然科学基金1项，广东省医学科研基金1项，市级34项。全年在国家核心刊物发表论文193篇，其中统计源期刊150篇，SCI 8篇。

市政府投资6.5个亿的新住院大楼面积达103000平方米，预计于2013年投入使用，届时医院将拥有1000张床位，开设10个儿内科病区、10个儿外科病区、五官科病区、小儿肿瘤科、感染科、儿童中医病区、儿童特需病房，总建筑面积近17万平方米。

医院秉承的办院理念是：办中国一流的儿童医院，为患儿提供快捷、安全、方便、有效的医疗服务，为医院和职工创造持久价值，实现患儿、医院、职工三方共赢。